系所沿革
國立屏東農業專科學校養殖科，係於民國67年成立
在80年改制為國立屏東技術學院後更名為水產養殖技術系
86年8月學校升格為國立屏東科技大學更名為水產養殖系
後於90年奉准設立碩士班
於100年奉准設立博士班
歷任系主任：
| 任期時程 | 姓名與職稱 |
| 107.2.1~110.1.31 | 曾美珍教授兼系主任 |
| 105 8.1~107.1.31 | 邱謝聰教授兼系主任 |
| 102.8.1~105.7.31 | 邱謝聰副教授兼系主任 |
| 100.8.1~102.7.31 | 翁韶蓮副教授兼系主任 |
| 97.8.1~100.7.31 | 鄭文騰教授兼系主任 |
| 94.8.1~ 97.7.31 | 葉信平教授兼系主任 |
| 91.8.1~ 94.7.31 | 葉信平教授兼系主任 |
| 88.8.1~ 91.7.31 | 鄭文騰副教授兼系主任 |
系友專區
傑出校友
83年度傑出校友 林育禾(芝林有限公司負責人)
84年度傑出校友 李明鏡(昌峰股份有限公司董事長)
87年度傑出校友 王國中(拉瑪國際企業有限公司負責人)
89年度傑出校友 李濟臺(長生魚場負責人)
91年度傑出校友 林嘉賓(彰化區漁會主任)
93年度傑出校友 黃建裕(東照企業股份有限公司經理)
94年度傑出校友 梁健傑(拉瑪貿易有限公司(馬來西亞)董事長)
98年度傑出校友 李望平(長征機構有限公司 區域經理)
100年度傑出校友 鄭平(台達電子工業股份有限公司 中國區總裁)
102年度傑出校友 鄭耀明(南投縣中醫師公會理事長、隆安中醫診所院長)
103年度傑出校友 何源興(水產試驗所東部海洋生物研究中心主任)
104年度傑出校友 蕭特財(馬來西亞美里市市政局市議員、TV10影音製作(馬)有限公司董事經理)
108年度傑出校友 陳福欽
